如果一种没有被申请专利的治疗A疾病的药物（大家都在生产）被一个人发现能治疗B疾病，那么他可以申请关于该药物治疗B疾病的专利。此时其他人仍然可以生产该药物，但是不能标注该药物具有治疗B的作用，只能标注具有治疗A的作用。
药物的物质专利和用途专利是分开的，所以不会出现发现一种重要工业品或生活品的特殊用途后申请专利导致这个物质被垄断的情况，因为这时候在物质上并没有创新，这个创新只仅限于用途。

我认为，类似楼主说的“氯化钠的一般合成方法”是不能申请专利的，具体请咨询法律行业的从业者。
这种必须物品的生产方法在知识产权这个概念形成之前就已经成为普遍的公共知识了，不能也不必追溯其产权归属。
仿制药并不是社会必需品，而且知识产权的本质是，通过部分公开知识来换取社会的对你个人权利的认可。换句话说，如果你的这种药物合成方法是有独创性的，那你不注册专利别人也合成不出来（只是要防着别人在没有任何参考的情况下仿制）。但是你愿意部分地公开和授权他人使用这种方法，为此，社会承认你在这种方法研发中的贡献，并对他人的使用作出一定的限制来保障你的权利。
此外，知识产权的适用范围、许可类型也有很多种，我不是学法律的，没研究过，楼主可以自行探究。

乙国研发了含碘化钾0.100%的氯化钠！
丙国研发了含碘化钾0.101%的氯化钠！
丁国研发了含碘化钾0.102%的氯化钠！
……

只要证明公共领域的氯化钠的合成和使用记录早于专利的注册时间，即可申请专利无效

专利是公开换保护，乙国技术人员可以学习甲国技术经验后受启发。

甲国发明的是大力丸，专利保护的是大力丸配方。
别人虽然不可以仿制大力丸，但是氯化钠这种天然就存在的物质以及提纯氯化钠的工艺都不在这个大力丸配方的专利里面。

在我国专利保护期只有几年，而在印度

首先，力量×2不符合常理，当然假设是可以的。其次，专利其实有bug的，不可以仿制，但是可以自主研发啊。最后，可口可乐的配料就是写在包装上的我也没见谁仿制。最最后，真正的尖端科技影响过大的技术是不申请专利的，技术是严格保密的。(影响太大的东西，谁管你呢，乙国直接仿制，然后找个小卡拉米背锅不就行了)再提一句，你对专利有严重误解，一个重大“发明”都会有很多专利，成百上千，想这种药物上万项专利都有可能。并不是说你一个“氯化钠”的专利别人就不能研制了。你想多了。